| • Famke Janssen foi originalmente escalada como Seleena, e chegou até a filmar algumas cenas, mas foi força a sair do projeto devido a morte de alguém em sua família. Lara Flynn Boyle, então, foi contrada em seu lugar.
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| • O final original do filme incluia uma cena em que as torres do World Trade Center se abriam e liberavam uma série de OVNIs. Depois do ataque as torres, o final do filme teve que ser alterado. |
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| • A história do filme é bem parecido com um episódio do desenho animado "Men in Black", exceto que os papéis dos agentes eram invertidos. |
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| • O comediante David Cross apareceu nos dois "MIB" mas em papéis diferentes. No segundo como Newton e no primeiro como um atendente no necrotério. |
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| • No trailer, Agent J conversa com um alien nos fundos da agência dos correios onde Kay trabalha. A "língua" é 'spit-rap', e o alienígena é interpretado por Biz Markee, um rapper da velha escola ameriana de rap. |
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| • O diretor Barry Sonnenfeld faz uma ponta como o pai de família que está assistindo TV quando Jay, Kay e as minhocas entram na sala para pegar armas. |
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| • O armário que os agentes Jay e Kay procuram é o C-18. O armário C-18 também é procurado em "O Nome do Jogo", que também é dirigido por Barry Sonnenfeld. |
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| • O cão orginal do primeiro "Homens de Preto" foi usado para fazer Frank, mas como o cão está sete anos mais velho, maquiagem teve que ser usada para cobrir os pelos brancos em volta de seu nariz. |
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| • No começo do filme, o logo da Columbia Pictures, a mulher segurando uma tocha está usando óculos escuros e sua tocha lança um flash assim como o neurolizador. |
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| • Dentre as várias pontas no filme temos a filha de Tommy Lee Jones (a filha no velho apartamento de K), os filhos de Will Smith (os dois garotos que olham para cima quando J e K passam voando) e Rick Baker, o maquiador dos alienígenas robôs, na base da MiB no balcão de registros de aliens (seu penteado que é sua marca registrada o entrega de cara). |
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| • O volante do "super-carro" é um controle de PlayStation 2. O que leva a piada de J sobre o GameBoy. |
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